La ministra de Salud, Ana María Vesga, alertó sobre la situación fiscal, presupuestal y administrativa que encontró en la cartera tras asumir el cargo y anunció medidas para revisar los recursos comprometidos durante la anterior administración. Según el Ministerio, la Contraloría emitió una opinión contable negativa sobre la vigencia 2025 y detectó deficiencias en el control interno fiscal.
Uno de los principales hallazgos corresponde a una diferencia cercana a $2,9 billones. En agosto de 2026, el rubro principal de asignaciones tenía una apropiación de $4,4 billones, de los cuales $4,3 billones estaban comprometidos, pero apenas $1,3 billones habían sido obligados y pagados. Además, fueron revisadas 28 resoluciones que contemplaban 176 proyectos por más de $490.000 millones, con 108 proyectos por unos $365.604 millones todavía sin registro presupuestal.
La ministra también puso en conocimiento de la Fiscalía General de la Nación posibles hechos de corrupción relacionados con estas asignaciones. Vesga aseguró que se habrían utilizado su nombre para exigir porcentajes o comisiones a cambio de gestionar recursos públicos. De acuerdo con reportes sobre la denuncia, existen audios en los que se menciona una presunta comisión del 8 %, aunque la funcionaria niega haber solicitado, autorizado o recibido dinero alguno.
Ante la gravedad de los hallazgos, el Ministerio de Salud suspendió temporalmente nuevos procesos de contratación, contratos y convenios, así como determinadas prórrogas, adiciones y modificaciones a contratos existentes. Vesga indicó que presentó personalmente la denuncia ante la Fiscalía el 5 de septiembre y aseguró que cada recurso comprometido será revisado para determinar si hubo irregularidades y establecer quiénes serían los responsables.